为鼓励上海微系统所科研人员的创新意识，本所已对2011年度授权的发明专利进行奖励。

根据上海微系统所专利管理办法，每件国内发明专利获授权后一次性奖励8000元，若第一发明人离所的，该项专利奖励4000元，此次奖励的授权发明专利共117项，奖励总金额达764000元。

近年来本所的专利申请量有了大幅增长，2011年上海微系统所的专利申请达到了279件，包括了40件国外专利申请，申请量位居全院第五名，受到了院里的表扬。但是，专利对于所的科技创新成果转化贡献还是不够，已有专利的可转化性尚待挖掘，科研人员在申请专利的前期也应考虑到市场的需求，希望共同为促进上海微系统所的科技创新成果转化做好预警及部署。